新疆昌吉职业技术学院是2001年6月经新疆维吾尔自治区人民政府批准，国家教育部备案的一所以工科为主的全日制公办高等职业技术学院。2013年，自治区人民政府将昌吉州卫生学校、昌吉市中等职业技术学校与昌吉职业技术学院整合，组建了新的昌吉职业技术学院，形成规模更大、专业门类更加齐全的中高职教一体化发展的院校。
学院目前占地面积895亩，建筑总面积24.3万平方米。目前在校生人数16000人，专任教师489人，其中研究生学历和在读研究生80人，高级职称182人，双师素质教师185人，拥有自动化生产线实训室 、机床电气维修实训室、GE自动化控制实训中心、建筑工程测量、3D模拟导游实训室、护理实训室、药学实训室160余间，图书馆藏书50万册。学院实行两级管理，下设十四个分院两个部，一厂两校。设有制造、电子信息、资源开发与测绘、土建、财经、医药卫生类等十个大类45个高职专业，35个中职专业，覆盖了昌吉州六大支柱产业主要领域，形成了以现代装备制造产业类专业为核心，以医药卫生类专业为支撑，带动土建和现代服务产业类专业共同发展的专业布局。
学院常年聘请行业专家为客座教授，建立了专家库，聘请行业、企业的能工巧匠和高技能人才承担50％以上专业课和实践课，并与天津大学、山东大学、四川大学建立本科函授站及远程教育。学院建立国际交流中心，与丹麦LearnMark Horsens职业学院开展国际交流合作项目。
昌吉职业技术学院办学条件、办学规模、办学效益及综合实力实现了超常规、跨越式发展。建成电气自动化技术六个自治区级特色专业；建成机电一体化技术等两个中央财政支持专业提升服务能力建设项目；“机电设备维修与管理”专业为自治区财政支持提升专业服务能力建设项目；“矿山机电”专业为自治区涉煤紧缺专业建设项目；护理等5个专业为自治区中职系列精品专业；电钳等3个专业为自治区技工系列重点专业。
《变压器结构与工艺》课程被评为国家自动化教指委精品课程；《护理学基础》等15门课程被评为自治区级精品课程；《新疆地方菜制作》等7门课程被评为州级精品课程；启动了《火电厂单元机组仿真机实训》等47门院级精品课程建设工作。
学院始终恪守以人为本理念，高度重视师资队伍建设，实施“人才强校”战略，一批师德高尚、教学能力强的优秀教师脱颖而出，建成自治区级教学团队3个，州级优秀教学团队2个； 2名自治区级教学名师、3名自治区级教学能手；7名州级教学名师；5名昌吉州学科带头人，9名昌吉州中青年骨干教师。
学院先后参加护理、加工制造、土木水利、财经商贸、旅游服务等八个大类的24个技能比赛项目，获得国家级奖项6个；自治区级奖项20个；90人次获得个人一、二、三等奖。
作为职业类院校，学院提出：把学生的动手能力、实践能力和可持续发展能力放在首位。不断加强校内外实验、实训、实习等实践基地的建设。在全疆率先启动实施自治州职教联盟合作发展工程、职业教育集团化办学工程（三个职教集团）、建立人社、教育资源共建、共享、共管的捆绑式发展创新工程，建立五位一体的现代就业准入制度创新工程。“四大工程”的实施，实现了政府、教育行政部门、行业主管部门、学校、企业联合育人，形成了“人才共育、过程共管、成果共享、责任共担”的紧密型政校企合作新机制。
办学实力的不断提升，社会各界给予广泛关注，报考昌吉职业技术学院的考生规模逐年扩大，生源质量逐年优化。近三年每年高职录取人数2410人、2550人、2841人。
学院为企业基层一线培养出下得去、用得上、留得住、发展好的高技能、高素质劳动者，实现了就业工作关注民生，职业教育让人民满意的办学目标，近三年毕业生就业人数分别为2824人、2910人、3082人；就业率分别为99.45％、99.36％、99.74％；用人单位对毕业生满意度达到90％以上。
昌吉职业技术学院于2007年国家教育部高职高专人才培养工作水平评估中获得“优秀”，2011年11月建成首批“自治区示范性高等职业院校”，同年进入全国首批20所“国家高技能人才培训基地”建设单位。先后荣获“全国职业教育先进单位”、“国家首批中等职业教育改革发展示范校”、“全国德育工作先进集体”、“全国百所德育示范学校”、“新疆职业院校思想政治教育科研工作先进学校”、“自治区职业培训先进集体”、“自治区文明单位”、“自治区依法治校示范校”等一系列殊荣。
昌吉职业技术学院新校区于2014年9月正式投入使用，学院将依托园区，全面提升职业教育服务自治州经济社会发展能力，为自治州实现“三个率先”提供智力支撑和人才保障，充分发挥学院对区州职业教育的引领示范作用。
